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试管婴儿技术被评为20世纪改变人类生活的重大科技发明之一，从诞生之日起就备受争议，但争论的焦点主要集中在伦理道德上，很少有人关注技术本身的安全性。

科学家们一直认为，婴儿健康的高风险主要来自父母双方的遗传。例如，糖尿病和高血压可能会伤害子宫内的婴儿。但近年来的研究表明，试管婴儿等辅助生殖技术也可能是触发因素之一，通过生育治疗出生的婴儿更容易患自闭症、癌症、脑瘫、智力低下等疾病。

2006年7月，伦敦某医院报告称，普通人群中自闭症的发病率为0.39%，而试管婴儿的风险高达1.56%，是普通人群的吃什么受孕率又快又高4倍。此外，白血病和脑肿瘤的发病率也高得多。

更小的问题，如注意力不集中和多动症，试管婴儿的发病率比正常婴儿高40%，影响听力和视力的疾病是正常婴儿的两倍。研究发现，接受生育治疗的儿童进入新生儿重症监护室并在医院停留三天以上的机会比其他人多30%。研究人员强调，这些数字代表相对风险。

瑞典乌普萨拉儿童医院的斯特罗姆贝里和他的同事发现，试管婴儿更容易出现明显的神经问题，尤其是脑瘫。相比之下，他们发现试管婴儿的脑瘫数量是普通婴儿的两倍多。斯特罗姆贝里博士认为，这些结果“很可能是由体外受精引起的”。

芬兰科学家最近的一项研究也表明，与自然怀孕出生的孩子相比，试管婴儿的身体比医院治疗女性不孕症的身体更差。芬兰国家健康与福利研究发展中心发现，体外受精儿童的整体健康状况令人担忧，各种疾病的患病率仍然很高。一些儿童疾病发病率的上升与试管婴儿数量的增加密切相关。

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美国旧金山加利福尼亚大学的玛丽·克罗根对2000名通过生育治疗怀孕的妇女和2000名自然分娩的母亲进行了一项跟踪比较调查。她发现原来不孕的女性在怀孕后会通过技术手段出现更多的并发症，如早产、惊厥、难产、剖腹产等。他们的孩子也比正常婴儿轻20%。

在2006年美国生殖医学学会年会上，CrowGayan说:“接受生育治疗后，大多数不孕夫妇所生的孩子都是健康的，但即使有一对夫妇的风险因素可能导致不健康的生育，那么这些因素也应该考虑在内。”

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